1987’de Ünal Erkan, Nevzat Ayaz ve Mehmet Ağar gibi polis teşkilatında üst düzey memurları ve siyasileri mafyayla bağlantılı olmakla suçlayan MİT raporunu hazırlamıştı. Rapor sızdırılmıştı.
Sızdırılan bu rapor sonrası, 10 Haziran 1988 yılında Mehmet Eymür istifaya zorlandı. MİT, raporun uygun izin alınmadan hazırlandığını açıklamıştı.
1997 yılında Mehmet Eymür, MİT temsilcisi olarak Washington DC'ye atandı. 1998'de Alaattin Çakıcı'nın yakalanmasının ardından Washington'dan merkeze geri çağrılmıştı.
Eymür, eski İçişleri Bakanı Mehmet Ağar'ın da aralarında olduğu 19 sanığın, 90'lı yıllardaki 18 faili meçhul cinayetle ilgili olarak yargılandığı davada, tanık olarak da ifade vermişti.