Uluslararası toplumun devreye girmesiyle 1995 yılında imzalanan Dayton anlaşması savaşı sonlandırdı.Anlaşma ile ülke üçe bölündü
Dayton ile ülke üç parçaya bölündü. Federasyon, entite ve özel statüye sahip Brcko bölgesi.
Nüfusun çoğunluğunu Boşnaklar oluştursa da toprak paylaşımı eşit yapıldı.
Savaşın ardından katledilen kurbanlar için arama çalışmaları başladı, kurbanlara ait kemik parçaları toplu mezarlardan çıkartıldı, binlercesi ise hala kayıp.